以下是云南省土地增值税政策的综合汇总，供参考。具体执行时请以最新官方文件及税务机关解释为准：

一、土地增值税基本政策依据

1. 国家层面

   • 《中华人民共和国土地增值税暂行条例》（国务院令第138号）
   • 《中华人民共和国土地增值税暂行条例实施细则》（财法字〔1995〕6号）
   • 财政部、税务总局相关配套文件（如财税〔2006〕21号等）。

2. 云南省地方政策

   • 云南省税务局根据国家政策制定具体实施细则，结合本地实际调整预征率、清算条件等。

二、云南省土地增值税核心政策要点

1. 预征管理

• 预征率（不同房产类型适用不同税率）：
  • 普通住宅：1%-2%
  • 非普通住宅：2%-3%
  • 商业、写字楼等：3%-5%
  • 具体执行标准由各州（市）税务机关在范围内确定（如昆明市可能高于偏远地区）。
• 预征时间：在取得房地产销售（预售）收入时预缴。

2. 清算条件

符合以下条件之一需进行土地增值税清算：

• 房地产开发项目全部竣工、完成销售；
• 整体转让未竣工决算项目；
• 直接转让土地使用权；
• 税务机关要求的其他情形（如销售比例达85%以上）。

3. 扣除项目

• 允许扣除的项目包括：
  • 取得土地使用权支付的金额；
  • 房地产开发成本（土地征用、前期工程、建筑安装等）；
  • 房地产开发费用（按比例计算或据实扣除）；
  • 与转让房地产有关的税金（如城建税、教育费附加）；
  • 加计扣除（房地产开发企业可加计20%）。

4. 税收优惠

• 普通住宅免税：增值额未超过扣除项目金额20%的，免征土地增值税。
• 政府征用/收回土地：因城市实施规划、国家建设需要而搬迁，纳税人自行转让房地产的，可免征。
• 旧房转让：按评估价格扣除，可能适用较低税率。

三、云南省特殊规定

1. 核定征收

   • 对符合核定征收条件的项目（如账簿不健全），税务机关可按核定征收率计算，云南省核定税率通常为 5%-8%（具体由各地确定）。

2. 合作建房政策

   • 一方出地、一方出资合作建房，分房自用的暂免征税；转让时需按规定缴纳。

3. 股权转让涉税处理

   • 以股权转让名义变相转让房地产的，税务机关可能参照土地增值税规定处理。

四、政策动态与注意事项

1. 关注地方调整
   • 各州（市）可能根据房地产市场情况调整预征率或清算细则（如昆明市2023年对商业地产预征率上调）。
2. 清算资料要求
   • 需提交项目竣工决算报表、测绘报告、销售清单等，具体要求以主管税务机关通知为准。
3. 数字化申报
   • 云南省已推行电子税务局办理土地增值税申报，需通过系统填报《土地增值税纳税申报表》。

五、官方查询渠道

1. 国家税务总局云南省税务局官网
   http://yunnan.chinatax.gov.cn
2. 12366纳税服务热线
3. 主管税务机关办税服务厅

提示：土地增值税政策复杂且可能动态调整，建议企业结合具体项目咨询专业税务机构或税务机关，确保合规性。如需政策文件原文，可通过上述官网搜索“土地增值税”获取。