根据中国现行税收政策，关于个人所得税代扣代缴手续费是否缴纳增值税的问题，需结合以下要点进行分析：

1. 政策依据

• 《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）
  附件1《销售服务、无形资产、不动产注释》明确：**“经纪代理服务”**属于增值税应税范围，指各类中介、代理服务（包括代扣代缴税款服务）。

• 《国家税务总局关于代扣代缴个人所得税手续费返还问题的批复》（国税函〔2001〕1004号）
  虽明确手续费收入需缴纳企业所得税，但未直接提及增值税。

• 后续政策口径
  各地税务机关在实际执行中普遍认为：企业取得的个人所得税代扣代缴手续费返还，属于提供“经纪代理服务”取得的收入，应按照**“现代服务—经纪代理服务”**缴纳增值税。

2. 税务处理要点

• 纳税人身份：

  • 若企业为一般纳税人，适用税率6%，可抵扣进项税额；
  • 若为小规模纳税人，适用征收率3%（2023年阶段性减按1%执行，需关注最新政策）。

• 开票与申报：
  手续费收入需按规定申报增值税，可开具增值税普通发票或专用发票（购买方为税务机关时通常无需开票，但需在申报表中体现收入）。

• 免税例外：
  目前无全国性免税政策，但个别地方可能对财政返还性质收入有特殊规定，需咨询主管税务机关。

3. 争议与实务建议

• 争议点：部分观点认为手续费是财政返还，非经营性收入，不应缴纳增值税。但主流执行中仍按应税处理。

• 风险提示：未申报增值税可能被认定为偷漏税，需补缴税款、滞纳金及罚款。

• 建议操作：

  1. 确认企业纳税人身份（一般/小规模纳税人）；
  2. 在增值税申报表（附表一）“经纪代理服务”栏次填报收入；
  3. 留存税务机关返还手续费的银行流水及文件备查。

4. 政策动态关注

2023年后，小规模纳税人增值税减免政策或有调整（如3%减按1%），需以最新文件为准。建议通过以下途径核实：

• 国家税务总局官网；
• 12366纳税服务热线；
• 主管税务机关的专项解答。

如需具体申报操作指引或地方性政策差异分析，可进一步提供详细信息。