《财政部 国家税务总局关于土地增值税若干问题的通知》（财税〔2006〕21号）是规范土地增值税政策的重要文件，主要针对2006年前后土地增值税征管中的突出问题作出补充规定。以下是该文件的核心内容概要：

一、关于转让旧房准予扣除项目的计算问题

1. 不能取得评估价格但能提供购房发票的

   • 可按发票所载金额并从购买年度起至转让年度止，每年加计5%计算扣除。
   • 购房契税若已包含在发票中，不再单独扣除；若未包含，可凭契税完税凭证扣除。
     （例：2000年100万元购房，2006年转让，扣除金额=100万×(1+5%×6年)+契税）

2. 既无评估价格又无购房发票的

   • 税务机关可实行核定征收，具体比例由地方确定。

二、关于土地增值税的预征和清算

1. 预征规定

   • 对未按预征率缴纳土地增值税的房地产项目，在清算时需补缴税款。

2. 清算条件

   • 明确符合以下情形之一时，税务机关可要求纳税人进行清算：
     • 项目竣工且销售比例≥85%；
     • 取得预售许可证满3年仍未销售完毕；
     • 纳税人注销开发企业资质等情形。

三、关于以房地产投资或联营的征税问题

• 以房地产投资、联营的：若所投资企业从事房地产开发，或房地产开发企业以其建造的商品房投资，需缴纳土地增值税；否则暂免征收。
• 2006年3月2日后的投资行为均按上述规定执行。

四、其他执行问题

• 强调各地需规范预征率调整、加强征管，并明确政策衔接时间节点。

政策背景与影响

• 目的：遏制房地产投机，规范税收漏洞，促进市场健康发展。
• 实操要点：旧房转让扣除更灵活，清算条件具体化，投资行为征税范围扩大。

如需全文或具体应用解读，建议通过财政部或税务总局官网查询原始文件，或咨询专业税务机构。