根据您提供的信息，您单位开具了一张3%征收率的增值税专用发票，但内容不完整。为给您准确的解答，需要您补充以下关键信息：

需补充的细节：

1. 业务类型：该发票对应的具体业务是什么？（如销售货物、提供服务、不动产租赁等）
2. 纳税人身份：您单位是小规模纳税人还是一般纳税人？
3. 其他业务情况：其他业务是按什么税率/征收率开具的？
4. 政策依据：是否涉及疫情期间减按1%征收率政策或其他税收优惠？

当前可能的政策适用（供参考）：

1. 小规模纳税人：

   • 2023年现行政策：适用3%征收率的应税收入，减按1%征收率开票（需注明"减按1%征收率"）。
   • 若您仍按3%开具，可能需按3%实际缴税（除非符合其他免税政策）。

2. 一般纳税人简易计税：

   • 特定业务（如建筑服务、销售自产货物等）可能适用3%简易计税，需符合财税〔2016〕36号等文件规定。

3. 发票合规性：

   • 若其他业务适用不同税率（如6%、9%、13%），需确保发票项目与税率匹配，避免混开风险。

建议操作：

1. 核对业务性质：确认该笔业务是否允许使用3%征收率。
2. 检查纳税人身份：小规模纳税人与一般纳税人的开票规则差异较大。
3. 联系主管税务机关：若存在政策执行疑问，建议以书面形式咨询税务部门。

请补充完整信息后，我将为您提供更精准的解答。