在预缴企业所得税时，权益法核算的长期股权投资收益的税务处理需根据中国税法规定区分具体情况，通常不能直接扣除，但需注意以下关键点：

1. 权益法投资收益的税务性质

• 会计处理：权益法下，投资方按持股比例确认被投资企业的净利润份额（投资收益），增加长期股权投资账面价值。
• 税务处理：税法不认可未实际分配的利润，因此权益法确认的投资收益属于税会差异，需纳税调增。

2. 预缴企业所得税时的扣除规则

• 不可扣除：根据《企业所得税法实施条例》第十七条，股息、红利等权益性投资收益以被投资企业作出利润分配决定的时间为纳税时点。因此，权益法下确认的未分配投资收益在预缴时不得扣除，需全额计入应纳税所得额。
• 例外情况：若被投资企业已实际宣告分红（如现金股利），且符合《企业所得税法》第二十六条规定的免税条件（如居民企业之间的股息红利），则可在预缴时作免税处理。

3. 预缴申报操作要点

• 填报方式：在《企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A类）》中：
  • 主表第3行“投资收益”需包含权益法确认的收益（需纳税调增）。
  • 若涉及免税股息红利，通过附表《免税收入、减计收入及加计扣除优惠明细表》填报免税部分。

4. 汇算清缴调整

• 年度汇算时，需通过《纳税调整项目明细表》（A105000）对权益法投资收益进行专项调整：
  • 调增：会计确认但未实际分配的收益。
  • 调减：后期实际分红且符合免税条件的部分。

5. 风险提示

• 避免重复纳税：若被投资企业后期分配利润，已纳税部分需在分配年度调减。
• 关注政策变化：如特殊政策（如区域性税收优惠）可能影响处理方式。

结论

在预缴阶段，权益法核算的长期股权投资收益通常需纳税调增，不得直接扣除；实际分配且符合条件时可申请免税。建议结合具体交易情况咨询税务机关或专业税务顾问，确保合规性。